北京医师协会于1999年11月成立，是北京地区注册的以执业医师、执业助理医师为主及单位会员自愿组成的全市性、行业性、非营利性的社会团体，是依据《中华人民共和国执业医师法》经原市卫生局同意，市社会团体行政主管机关核准注册登记的社团法人。协会的业务主管单位是北京市卫生健康委；登记管理机构是北京市民政局。党建工作机构是北京医师协会党建工作小组。协会现任第五届理事会会长为郭积勇（北京市卫生健康委退休）、法人为张永利副会长（北京地坛医院退休）、秘书长为郭建平（北京世纪坛医院退休）。

协会宗旨：以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导、深入贯彻落实科学发展观和习近平总书记新时代中国特色社会主义思想，遵守宪法、法律、法规和国家政策，践行社会主义核心价值观，遵守社会道德风尚，恪守公益宗旨，积极履行社会责任，自觉加强诚信自律建设，诚实守信，规范发展，提高社会公信力。负责人遵纪守法，勤勉尽职，保持良好个人社会信用。发挥行业协会服务、协调、自律、维权、监督、管理作用，团结和组织北京地区的医师实施行业自律，维护医师的合法权益，促进卫生领域依法执业、依法管理，为人民健康和社会主义建设服务。

业务范围：协助卫生行政部门开展执业医师的考核验证、培训，事故纠纷调查、认证和审议，国内外医师交流，评选奖励优秀医务工作者，推广新技术成果，咨询服务和政府委托的工作。